Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3290441	3290486	46	33 [0]	[0] 71	yraJ	predicted outer membrane protein

CGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCG  >  W3110S.gb/3290380‑3290440                                                             | cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:731769/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:281513/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:2986/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:315995/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:393149/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:429723/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:437589/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:518309/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:65296/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:217137/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:742351/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:803405/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:823945/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:837127/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:884936/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:946783/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:969367/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1014094/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1637527/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1590157/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1480738/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1442590/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1407114/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1391909/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1386748/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1382467/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1370192/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:129767/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1280261/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:127889/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1268372/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1078908/1‑61 (MQ=255) cGTTAGAACGCTGGTTACCGCCTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCg  >  1:1591615/1‑61 (MQ=255)                                                             | CGTTAGAACGCTGGTTACCGCGTAGCCGGGTTTCCTATCAGATGACCAGCCAGAAAGATCG  >  W3110S.gb/3290380‑3290440

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑