Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3352475	3352566	92	94 [1]	[0] 25	arcB	hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with ArcA

GAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCAG  >  W3110S.gb/3352413‑3352475                                                              |  gAATGAGGTTTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:420209/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:322273/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:486052/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:479817/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:44856/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:433955/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:413178/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:400171/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:397060/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:351079/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:34952/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:325136/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:499154/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:272116/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:271660/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:268485/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:256876/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:256058/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:242558/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:24222/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:227648/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:219166/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:210416/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1033172/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:749026/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:971047/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:897723/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:890626/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:857571/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:847860/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:847268/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:832026/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:829625/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:808667/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:80826/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:805753/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:208419/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:666704/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:642471/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:640460/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:639725/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:58080/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:57410/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:572665/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:554489/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:545350/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:532659/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1160052/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1336974/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1298260/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1286803/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1236721/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1231542/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1226204/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1210733/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1198517/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1192839/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1186411/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1176547/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1339167/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1118297/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1109993/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1108884/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1099984/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1096281/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1095968/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1090875/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1072735/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:104822/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1043362/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:151698/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:166481/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1651396/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1620636/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1619279/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1617355/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1604710/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1578101/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1542778/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:207313/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1491730/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1489656/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:144368/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1413488/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1407714/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1400202/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1385220/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1377714/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1362356/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1359703/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1347304/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTT‑AATTTTCAg  >  1:961782/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCACGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1618212/1‑62 (MQ=255) gAATGAGGATTGCTGCTCGAGCGGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCa   >  1:1597025/1‑62 (MQ=255)                                                              |  GAATGAGGATTGCTGCTCGAGCTGAATTTGTGTCTCTTCGCGCTCTTTGATTTCAATTTTCAG  >  W3110S.gb/3352413‑3352475

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑