Missing coverage evidence...
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GCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAC  >  W3110S.gb/3373157‑3373217                                                             | gCATGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1403633/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGTTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1402049/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:442351/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1027229/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1592606/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:17173/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:214985/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:22277/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:264371/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:314570/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:417089/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:426211/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1561743/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:659945/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:688260/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:709048/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:72231/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:862971/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:873872/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:877220/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:908834/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:930540/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:986052/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1304736/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1057107/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1100926/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:111802/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1160918/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1202577/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1204564/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1205073/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:122501/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1281660/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1545466/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1331533/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1361061/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1370327/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1388745/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1397008/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1470428/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:148202/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1508358/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:154287/61‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGCTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:1610761/61‑1 (MQ=255)  cAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:797487/60‑1 (MQ=255)            gCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAc  <  1:976964/50‑1 (MQ=255)                                                             | GCAAGTTGTTGGCTTTCGGCGGTGCTGACGCAACCGACGTGGGCGATGAGTTTAATCTTAC  >  W3110S.gb/3373157‑3373217

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑