Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3413352	3413671	320	94 [0]	[2] 14	envR/acrE	DNA‑binding transcriptional regulator/cytoplasmic membrane lipoprotein

TGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGA  >  W3110S.gb/3413305‑3413351                                               | tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:473880/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:637019/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:624938/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:61855/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:589179/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:582125/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:579902/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:565026/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:558308/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:537994/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:50988/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:488072/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:668772/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:446750/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:445258/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:43615/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:435813/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:422953/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:409483/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:397384/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:395767/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:383720/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:352924/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1040792/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:865192/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:988906/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:977951/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:970162/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:95717/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:951284/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:950716/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:934204/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:932265/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:921587/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:920879/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:881814/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:344898/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:84275/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:836663/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:820110/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:815000/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:789089/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:744189/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:740781/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:688770/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:681898/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:678418/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1249164/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:338827/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1355773/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1330360/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1304656/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1294873/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1294559/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1292980/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1283810/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1274641/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1270979/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1255689/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1357561/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1236750/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1236740/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1235795/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1233144/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1218349/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1209955/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1190410/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1106477/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1093928/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1045596/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1504434/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:318687/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:284151/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:282117/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:203239/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1617762/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1615768/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1605030/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1581509/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1575016/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1554002/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1372071/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1492789/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1480778/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1466114/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1463796/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1459389/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1438622/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1432637/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1410757/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1388447/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:1376008/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTAGa  >  1:125181/1‑47 (MQ=255) tGGTTCTTATTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGa  >  1:954579/1‑47 (MQ=255)                                               | TGGTTCTTTTTGCCATGATTAATTATTCAGGAAATAAATATATTCGA  >  W3110S.gb/3413305‑3413351

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑