Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3461385 3461433 49 93 [0] [0] 52 thrU/coaA tRNA‑Thr/pantothenate kinase

GCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACG  >  W3110S.gb/3461323‑3461384
                                                             |
gagAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:727221/60‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATATTTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1055294/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTTTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1551687/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGTTCACATTTTATGCGACACg  <  1:634178/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:402531/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:566816/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:541101/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:516258/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:506998/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:477622/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:453414/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:434361/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:433043/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:432211/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:429417/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:577337/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:390548/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:373413/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:35544/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:348493/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:335637/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:32757/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:304827/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:29832/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:297660/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:757426/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:992400/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:938845/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:918486/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:841166/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:838126/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:814201/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:794290/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:776402/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:767191/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:762033/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:572785/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:753042/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:731027/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:698023/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:675166/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:637572/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:626643/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:611471/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:591077/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:279046/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:123859/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1414658/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1407270/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1404900/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1385029/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1374799/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1370189/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1334417/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1327146/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1296086/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1395684/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1234379/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:122790/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1211436/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1200277/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1163426/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:115561/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1041340/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1014279/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1433318/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:258095/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:238473/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:224774/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:217865/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:216896/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:207956/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1589403/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:144159/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1424429/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1438756/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1495006/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1469815/62‑1 (MQ=255)
gCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1488733/62‑1 (MQ=255)
 cGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTTTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:125092/61‑1 (MQ=255)
 cGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:126408/61‑1 (MQ=255)
 cGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1634483/61‑1 (MQ=255)
 cGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:704330/61‑1 (MQ=255)
 cGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:309080/61‑1 (MQ=255)
 cGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1157673/61‑1 (MQ=255)
 cGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1397397/61‑1 (MQ=255)
 cGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1309043/61‑1 (MQ=255)
   aGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1513503/59‑1 (MQ=255)
      tCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1495136/56‑1 (MQ=255)
                 aaaaaTTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1195099/45‑1 (MQ=255)
                   aaaTTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:1050093/43‑1 (MQ=255)
                     aTTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:100364/41‑1 (MQ=255)
                        gCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACg  <  1:897990/38‑1 (MQ=255)
                                                             |
GCGAGTTCATGCAACTAAAAAATTGCATAATTTGTTTTATTGGTCACATTTTATGCGACACG  >  W3110S.gb/3461323‑3461384

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: