Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3501797	3502295	499	40 [0]	[0] 31	katG	catalase/hydroperoxidase HPI(I)

GGTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTC  >  W3110S.gb/3501735‑3501796                                                              | ggTTTACGTTTCTTCGAGGGATCAAACGGTTCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1262236/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:470442/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1035942/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1608144/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1611455/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1642140/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:16446/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:327286/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:437623/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:441711/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:463395/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1590699/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:594835/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:620156/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:750853/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:761969/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:79112/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:810239/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:870553/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:915588/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1512200/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1058516/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1108854/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1116045/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1169127/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1192504/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1207448/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1226758/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:131361/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1320445/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1424983/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1465050/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1510052/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1579975/62‑1 (MQ=255) ggTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGGGCGTCTACCGCTTc  <  1:1297080/62‑1 (MQ=255)  gTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1417864/61‑1 (MQ=255)  gTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:1435575/61‑1 (MQ=255)    ttACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:768175/59‑1 (MQ=255)                   ggATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:653298/44‑1 (MQ=255)                       cAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTc  <  1:144377/40‑1 (MQ=255)                                                              | GGTTTACGTTTCTTCGACGGATCAAACGGATCCGGGATAATTTCCGGTGCGTCTACCGCTTC  >  W3110S.gb/3501735‑3501796

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑