Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3537196	3537347	152	89 [0]	[0] 62	rhaR	DNA‑binding transcriptional activator, L‑rhamnose‑binding

TTGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTT  >  W3110S.gb/3537136‑3537195                                                            | ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGGATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1127780/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:35692/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:597301/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:579401/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:563779/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:555108/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:496027/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:486010/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:47576/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:475138/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:465681/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:36774/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:616967/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:316917/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:308824/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:294986/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:284764/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:2550/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:238459/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:222588/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1000648/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1646332/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:804897/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:987676/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:960656/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:947913/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:940942/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:935364/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:926848/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:924438/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:855131/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:828821/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:807720/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:605193/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:802442/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:800059/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:787756/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:767822/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:740142/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:683517/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:672741/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:652055/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1648309/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1224206/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1332545/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1639843/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1316954/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1303107/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:128543/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:126391/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:124508/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1241055/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1237840/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1327292/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:120092/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1200109/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1195441/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:111608/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1115911/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1084972/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1048281/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1047951/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1002581/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1379495/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1636846/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1610469/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1600888/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1591437/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1559872/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1547273/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1533104/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1487163/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1448125/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1435981/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:142365/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1406400/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1403109/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1334262/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCAAGGCGAATTAATCttt  <  1:1219021/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCAACGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1403340/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGGCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:662350/60‑1 (MQ=255) ttGTGTGGGGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1472979/60‑1 (MQ=255)  tgtgtgGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGTCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:319321/59‑1 (MQ=255)  tgtgtgGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1485184/59‑1 (MQ=255)     gtggtgATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:274432/56‑1 (MQ=255)          gATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1276926/51‑1 (MQ=255)            ttattGTGGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:603385/49‑1 (MQ=255)             tattGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:1170135/48‑1 (MQ=255)                         tAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCttt  <  1:794116/36‑1 (MQ=255)                                                            | TTGTGTGGTGATTATTGTCGCCGCTAACATCGTCGGCATCGGCATGGCGAATTAATCTTT  >  W3110S.gb/3537136‑3537195

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑