Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3547771	3548748	978	61 [0]	[0] 114	[frvR]–[yiiG]	[frvR],[yiiG]

AGAGCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACTTT  >  W3110S.gb/3547709‑3547770                                                              | agatCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1505761/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:352742/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:346749/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:358173/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:384248/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:409637/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:42141/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:428323/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:449591/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:541869/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:555845/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:564189/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:567791/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:605205/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:608899/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:609103/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:619588/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:634441/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:712797/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:729435/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:742178/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:785634/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:810692/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:866910/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:87331/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:947131/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:95228/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:971974/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:988293/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:995086/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1583720/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1014983/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1064195/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1108073/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1174113/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1184168/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1185393/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1188558/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1194333/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1238768/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1243748/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1260821/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1317126/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1325125/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:142232/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1001524/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1611717/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1618058/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1633346/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:163526/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:1647214/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:176556/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:190731/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:212500/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:23673/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:240949/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:259191/62‑1 (MQ=255) agagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:324883/62‑1 (MQ=255)  gagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:230848/61‑1 (MQ=255)  gagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:946795/61‑1 (MQ=255)  gagCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACttt  <  1:412716/61‑1 (MQ=255)                                                              | AGAGCAGCATGAATAACCTGAAAGCCGCCTGGCCTGCGGCCTTTGATATGAGTCTGCACTTT  >  W3110S.gb/3547709‑3547770

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑