Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3549175	3549619	445	41 [0]	[0] 108	yiiG	conserved hypothetical protein

TTCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCA  >  W3110S.gb/3549120‑3549174                                                       | ttCCCTTTCGCAAACTCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1537387/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:579940/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:243978/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:266920/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:299420/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:341679/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:343863/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:4496/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:488641/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:557375/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:578518/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:197203/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:594453/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:639995/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:645426/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:707987/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:77282/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:815835/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:82931/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:863003/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:955027/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1340579/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1043971/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1078675/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:108540/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1095014/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:111658/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1118241/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1132397/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1291294/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1332542/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1031736/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1377667/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1446333/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1484967/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1598702/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:1614576/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:162856/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:181558/55‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTACTGGGTGTAATATTTATCCa  <  1:167663/55‑1 (MQ=255)                 cATCGTGTTTATTATTTTCATGGGTGTAATATTTATGCa  <  1:302477/39‑1 (MQ=25)                                                       | TTCCCTTTCGCAAACGCATCGTCTTTATAATTTTCCTGGGTGTAATATTTATCCA  >  W3110S.gb/3549120‑3549174

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑