Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3582196	3582628	433	60 [0]	[0] 13	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

CCGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTG  >  W3110S.gb/3582135‑3582195                                                             | cctcTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:651237/58‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTGCCGCGTTg  <  1:197498/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:587554/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:289187/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:31122/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:312642/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:316836/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:337632/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:367696/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:378100/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:400802/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:446899/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:45081/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:474597/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:488494/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:543995/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:24463/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:590170/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:607396/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:625786/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:678444/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:710648/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:716282/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:716441/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:720868/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:771561/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:862561/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:88339/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:883806/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:924475/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1333358/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1029880/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:110511/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1121907/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1135649/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1224250/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1238329/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:128355/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:128784/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1296634/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1022903/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1353534/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1410364/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1545316/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:225005/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:190696/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1604951/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1577902/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1434393/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1525883/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1518139/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1516352/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1480611/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1450839/61‑1 (MQ=255) ccGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGACAGTTTTACCGCGTTg  <  1:810082/61‑1 (MQ=255)  cGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1180157/60‑1 (MQ=255)  cGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1032375/60‑1 (MQ=255)            gCAGACGCGTTTGCTTCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:181009/50‑1 (MQ=255)                   cgTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1258386/43‑1 (MQ=255)                       tgctgcGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTg  <  1:1298314/39‑1 (MQ=255)                                                             | CCGCTGGATGTGCAGACGCGTTTGCTGCGCGTGCTGGCAGACGGTCAGTTTTACCGCGTTG  >  W3110S.gb/3582135‑3582195

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑