Missing coverage evidence...
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TGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGT  >  W3110S.gb/13682‑13743                                                              | tGAACTAAGATGAAATCCATAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:271382/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATTAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1615313/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:572718/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1618949/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1049236/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:271894/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:280468/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:297101/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:353233/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:369343/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:384398/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:224634/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:591509/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:593601/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:598002/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:60159/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:605021/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:629779/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:695049/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:845184/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:932950/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:9402/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1314692/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:106137/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:112803/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1138033/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1206207/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1225078/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1261562/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:129623/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1320088/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1374126/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1390544/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1398505/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1452960/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1453732/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1499937/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:158988/62‑1 (MQ=255) tGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACACAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:665485/62‑1 (MQ=255)  gAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:43430/61‑1 (MQ=255)  gAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1430308/61‑1 (MQ=255)  gAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:831856/61‑1 (MQ=255)  gAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:845138/61‑1 (MQ=255)    aCGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1615356/59‑1 (MQ=255)    aCGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:667419/59‑1 (MQ=255)          aTGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:126582/53‑1 (MQ=255)                      aaaTGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1430183/41‑1 (MQ=255)                       aaTGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGt  <  1:1476565/40‑1 (MQ=255)                                                              | TGAACGAAGATGAAATCCAGAAAATGGTACGCGACGCAGAAGCTAACGCCGAAGCTGACCGT  >  W3110S.gb/13682‑13743

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑