Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3627650	3627657	8	54 [1]	[0] 6	rhtB	neutral amino‑acid efflux system

TGTGGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTACCT  >  W3110S.gb/3627588‑3627650                                                              |  tgtgGCACAAAAATATACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1273276/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGCCACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1419232/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGTGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1515111/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCTTCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:434207/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:645041/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:329185/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:364135/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:416099/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:447611/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:52060/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:522017/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:523844/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:541450/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:563050/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:638100/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:644072/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:312563/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:658799/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:667922/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:671725/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:695494/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:854205/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:879472/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:906183/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:933441/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:937205/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:98117/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:998753/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1456858/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1056347/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1071702/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1075956/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1100902/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:112990/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1137415/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1243142/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1271066/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1275344/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:136615/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1443886/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:100054/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1470591/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1579319/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:1588780/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:179232/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:192065/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:19425/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:221525/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:25729/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:260449/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:294891/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGGTTGCCTAcc   >  1:574832/1‑62 (MQ=255) tgtgGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTACAATGGTGGTTTGCCTAcc   >  1:598479/1‑62 (MQ=255) tgtgGCAC‑AAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTACct  >  1:1395855/1‑62 (MQ=255)                                                              |  TGTGGCACAAAAATAGACACACCGGGAGTTCATCATGACCTTAGAATGGTGGTTTGCCTACCT  >  W3110S.gb/3627588‑3627650

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑