Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3640675	3641150	476	75 [0]	[0] 20	[yigA]–[dapF]	[yigA],[dapF]

ATAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATG  >  W3110S.gb/3640613‑3640674                                                              | aTAGTTCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:179483/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:463083/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:486525/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:365014/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:334385/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:262395/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:251134/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:222716/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:21684/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:189714/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:173621/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:170534/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1646737/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:164166/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1624737/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1619191/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:156363/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1546753/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:805720/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:95564/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:949191/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:947976/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:912345/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:897713/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:883359/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:830827/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:824414/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1027567/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:802104/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:800102/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:719680/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:677480/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:674983/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:644624/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:635170/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1323309/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1098671/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1102030/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1095635/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1090736/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1182438/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1227709/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1247368/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1250535/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1255925/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1261734/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1077065/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:127267/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1060469/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1049835/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:129530/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1325815/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1328327/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:137025/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1371241/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1375864/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1388918/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1392669/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:103293/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:154469/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1447227/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:145823/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1531200/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1535593/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1540369/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTGCCCCAAAAGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:959454/62‑1 (MQ=255) aTAGTGCTGTTCCTACCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1287328/62‑1 (MQ=255)  tAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGTTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1650341/61‑1 (MQ=255)  tAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1181893/61‑1 (MQ=255)   aGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1161397/60‑1 (MQ=255)   aGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1394301/60‑1 (MQ=255)     tGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:476156/58‑1 (MQ=255)             cTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:1002460/50‑1 (MQ=255)                       cGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:345092/40‑1 (MQ=255)                          tGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATg  <  1:823987/37‑1 (MQ=255)                                                              | ATAGTGCTGTTCCTGCCCCAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATG  >  W3110S.gb/3640613‑3640674

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑