Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3645321 3645621 301 71 [0] [0] 11 [cyaA] [cyaA]

CTTTCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGTT  >  W3110S.gb/3645258‑3645320
                                                              |
cTTTCGGCGGATCCTGTACTGACATCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1137869/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTATTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1170453/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:422077/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:580871/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:562698/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:55816/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:552196/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:545078/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:506790/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:478316/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:471805/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:605202/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:362888/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:337693/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:286139/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:265552/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:23732/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:187050/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:185674/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:777109/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:977602/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:95979/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:914284/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:857496/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:855170/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:853582/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:84992/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:808363/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:603756/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:749361/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:74909/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:738070/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:717442/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:700312/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:614754/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:172375/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1155914/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1010093/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1424206/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1363864/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1329012/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1322780/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1220485/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1203443/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1190065/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1426366/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1152118/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1140906/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1062247/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1053152/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1030919/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1028573/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1022918/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1436740/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1635082/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1587789/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1586931/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1572638/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1568097/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1456017/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1449799/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1449118/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1448990/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1444828/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1437366/62‑1 (MQ=255)
 tttCGGCCGATCCTGTACTGACATTCCTCGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1439566/62‑1 (MQ=255)
  ttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:42054/61‑1 (MQ=255)
  ttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:373944/61‑1 (MQ=255)
  ttCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1422218/61‑1 (MQ=255)
             cTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1426689/50‑1 (MQ=255)
                         tCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGtt  <  1:1039662/38‑1 (MQ=255)
                                                              |
CTTTCGGCGGATCCTGTACTGACATTCCACGATACAGTTCAAGCTCGTTCAGGTAGTGGCGTT  >  W3110S.gb/3645258‑3645320

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: