Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3696136	3696396	261	87 [0]	[1] 33	hsrA	predicted multidrug or homocysteine efflux system

AGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAT  >  W3110S.gb/3696074‑3696135                                                              | aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTTCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:217977/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTTGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:298429/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:619068/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:62011/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:61183/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:593532/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:581798/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:559603/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:559580/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:543638/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:534787/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:53404/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:522134/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:481899/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:449774/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:424557/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:383197/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:368841/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:366668/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:348811/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:328379/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:320942/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:79555/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:977770/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:969037/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:968379/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:965979/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:958109/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:937898/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:899226/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:867592/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:836617/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:799136/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:265305/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:783801/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:763500/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:736603/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:736271/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:719040/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:713312/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:707690/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:694996/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:669468/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1237592/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1400483/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1012413/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1347049/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1336472/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1307319/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1297963/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1289647/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1249172/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1246215/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1386343/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1227346/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1194868/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1180505/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1160111/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1131405/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1086952/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1029863/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:102164/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1016156/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:248979/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:187185/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:162879/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:21377/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1584693/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1581651/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1541023/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1536963/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:221197/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1521218/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1503989/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:140180/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1503663/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1461809/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1461504/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:145009/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1441866/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1412350/62‑1 (MQ=255) aGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGATTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:738621/62‑1 (MQ=255)  gCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:264559/61‑1 (MQ=255)  gCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:915725/61‑1 (MQ=255)  gCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1277512/61‑1 (MQ=255)       aaaaaGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1291542/56‑1 (MQ=255)            gaagGGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAt  <  1:1530397/51‑1 (MQ=255)                                                              | AGCGATAAAAAGAAGCGCAGTATGGCGGGTTTGCCGTGGATCGCGGCGATGGCCTTCTTCAT  >  W3110S.gb/3696074‑3696135

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑