Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3730278	3730556	279	66 [1]	[1] 42	bglG	transcriptional antiterminator of the bgl operon

AAAAACGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGT  >  W3110S.gb/3730216‑3730277                                                              | aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTGAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1142151/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAGGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:51098/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:573561/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:674206/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:645265/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:630358/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:626116/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:618593/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:602619/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:590833/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:580992/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:702778/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:563470/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:54648/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:541005/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:503166/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:488426/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:437863/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:427143/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:711837/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:747902/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:763310/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:781974/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:801161/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:849259/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:856808/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:866766/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:878067/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:880093/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:89213/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:902258/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:919697/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:964411/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:965549/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1545950/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:113175/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1154824/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1179551/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1211487/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1233702/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1233724/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1264195/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1311778/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1343824/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1425124/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1426419/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1428183/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1469255/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1491635/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1510711/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1034483/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1558739/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1587246/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1597612/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1642843/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:1647426/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:213417/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:232926/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:283174/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:285148/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:300740/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:323213/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:32823/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:375683/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:400071/1‑62 (MQ=255) aaaaaCGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGt  >  1:41857/1‑62 (MQ=255)                                                              | AAAAACGCGCTGGCGAAAGAATTAACTCAAGTGGAATAGAAAAAGAGTATGCCTTGAGCAGT  >  W3110S.gb/3730216‑3730277

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑