Missing coverage evidence...
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CTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGTTA  >  W3110S.gb/3735840‑3735901                                                             |  cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGttt   >  1:586878/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:1143065/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:909327/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:843576/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:778165/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:657364/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:620017/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:60835/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:574503/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:548474/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:486164/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:432394/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:1640476/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:148652/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:147799/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:1385631/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:1313024/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:1292988/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:1275436/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:1238362/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:1183955/1‑61 (MQ=255) cTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGtt   >  1:105901/1‑61 (MQ=255)  ctggCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGTta  >  1:316201/3‑61 (MQ=255)                                                             |  CTGGGCTATTTCACCCAGCAAAACAAAGATGCGAATAGTAATAAATTTAATGAGTCTGGTTA  >  W3110S.gb/3735840‑3735901

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑