Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3771944	3772083	140	13 [0]	[0] 9	yidR	conserved hypothetical protein

CAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAA‑CCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGCGTCGT  >  W3110S.gb/3771883‑3771943                                                              | cAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:1088387/62‑1 (MQ=255) cAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:1224411/62‑1 (MQ=255) cAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:1529877/62‑1 (MQ=255) cAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:299044/62‑1 (MQ=255) cAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:524001/62‑1 (MQ=255) cAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:52841/62‑1 (MQ=255) cAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:738457/62‑1 (MQ=255) cAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:746482/62‑1 (MQ=255) cAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:749277/62‑1 (MQ=255) cAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:908662/62‑1 (MQ=255) cAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:99763/62‑1 (MQ=255)  aGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:1498746/61‑1 (MQ=255)  aGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAACCCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGcgtcgt  <  1:1603997/61‑1 (MQ=255)                                                              | CAGGTGATGCGCCGTTAAGCGGAACGGAAACAA‑CCCTGCCCGCGCCACCGCGTGGCGTCGT  >  W3110S.gb/3771883‑3771943

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑