Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3802760	3802970	211	48 [0]	[0] 21	setC	predicted sugar efflux system

CCAGTCAGTTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTA  >  W3110S.gb/3802698‑3802759                                                              | ccAGTCAGTTTATCGGTT‑‑ATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1481592/60‑1 (MQ=37)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:458173/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1576659/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1613850/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:175605/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:181091/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:261087/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:276964/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:333143/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:343854/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:402585/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:423311/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1572990/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:467200/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:58070/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:59381/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:804516/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:825420/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:869663/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:875958/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:888853/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:909030/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:954447/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:984537/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1412608/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:110532/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1164612/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1186052/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1233091/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1296445/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1300765/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1307613/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:13304/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:13671/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1393421/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1046230/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1439681/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1464303/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1482510/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:148837/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1506046/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1507164/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1522438/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1530443/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1534871/59‑1 (MQ=255)    gtcagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1544648/59‑1 (MQ=255)      gagtTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATATATAGCGGCATATTTATCATGTa  <  1:1542490/56‑1 (MQ=255)         tttATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCTGGATATTTATCATGTa  <  1:842798/54‑1 (MQ=38)                                                              | CCAGTCAGTTTATCGGTTAGATGCAGTTCATCAATAATAAATAGCGGCATATTTATCATGTA  >  W3110S.gb/3802698‑3802759

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑