Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3811688	3812625	938	71 [0]	[0] 110	[gltS]	[gltS]

TTCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGA  >  W3110S.gb/3811626‑3811687                                                              | ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:445629/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:6081/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:598753/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:589297/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:57961/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:5732/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:567972/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:513505/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:463614/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:636640/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:414136/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:370793/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:360954/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:35700/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:335047/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:327236/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:311177/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:310404/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:868107/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:999465/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:998981/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:980987/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:974976/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:963040/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:959362/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:897628/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:884701/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:298872/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:860983/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:804746/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:760219/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:715684/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:69233/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:671445/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:66015/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1143163/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1015618/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1329691/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1287443/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:126374/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1245251/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1242154/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1158689/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1149081/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:136261/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1141169/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1136982/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1132896/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1094026/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1076031/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1065963/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1054127/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1019504/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:210141/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:282297/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:282124/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:280775/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:272267/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:261417/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:249481/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:219704/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:212775/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:140276/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:189390/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:161751/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1594703/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1577738/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1531409/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1453267/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGa  >  1:1407294/1‑62 (MQ=255) ttCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCAGTCATAGTTCATGa  >  1:726192/1‑62 (MQ=255)                                                              | TTCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGA  >  W3110S.gb/3811626‑3811687

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑