Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3817090	3817656	567	29 [0]	[0] 29	spoT	bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

TCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGATCA  >  W3110S.gb/3817030‑3817089                                                            | tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1574042/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:927839/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:922147/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:85804/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:737521/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:704316/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:655836/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:55606/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:461395/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:457862/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:33000/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:274999/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:216600/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1590578/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1033397/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:15445/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1514075/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1413702/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1317849/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1272986/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1237490/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:11665/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1163240/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1156193/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1143892/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1136381/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1054370/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:1039087/1‑60 (MQ=255) tCTGGTCCATATCTTCGGTAAGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGatca  >  1:482103/1‑60 (MQ=255)                                                            | TCTGGTCCATATCTTCGGTACGGATCTGGACCTCAACCGGCACACCGTGCGGGCCGATCA  >  W3110S.gb/3817030‑3817089

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑