Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3827904	3827987	84	31 [0]	[0] 59	yicR	protein associated with replication fork, possible DNA repair protein

CACAAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGA  >  W3110S.gb/3827842‑3827903                                                              | cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1461885/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:970680/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:884958/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:833009/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:646301/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:588466/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:570681/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:514669/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:425252/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:390329/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:32012/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:271936/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:207458/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:184020/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:179543/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1521115/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1049231/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1453/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1431963/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1409750/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1351201/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:135112/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1342018/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1333291/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1326377/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1261232/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1255117/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1203499/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1164969/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:112139/1‑62 (MQ=255) cacaAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGa  >  1:1097363/1‑62 (MQ=255)                                                              | CACAAAGGAGGTGAAGGTGAAAAACAATTCACAGCTGTTGATGCCGCGCGAAAAAATGCTGA  >  W3110S.gb/3827842‑3827903

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑