Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3844774	3844991	218	9 [0]	[0] 135	rfaF	ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II

ATCAGGATAACCGCTTGATCAAGCTGTGTTTCCCCCGCCAGGTTCCGACACCATGCCTGCT  >  W3110S.gb/3844713‑3844773                                                             | aTCAGGATAACCGCTTGATCAAGCTGTGTTTCCCCCGCCAGGTTCCGACACCATGCctgct  <  1:111040/61‑1 (MQ=255) aTCAGGATAACCGCTTGATCAAGCTGTGTTTCCCCCGCCAGGTTCCGACACCATGCctgct  <  1:1219826/61‑1 (MQ=255) aTCAGGATAACCGCTTGATCAAGCTGTGTTTCCCCCGCCAGGTTCCGACACCATGCctgct  <  1:1282072/61‑1 (MQ=255) aTCAGGATAACCGCTTGATCAAGCTGTGTTTCCCCCGCCAGGTTCCGACACCATGCctgct  <  1:1372417/61‑1 (MQ=255) aTCAGGATAACCGCTTGATCAAGCTGTGTTTCCCCCGCCAGGTTCCGACACCATGCctgct  <  1:1525669/61‑1 (MQ=255) aTCAGGATAACCGCTTGATCAAGCTGTGTTTCCCCCGCCAGGTTCCGACACCATGCctgct  <  1:1582410/61‑1 (MQ=255) aTCAGGATAACCGCTTGATCAAGCTGTGTTTCCCCCGCCAGGTTCCGACACCATGCctgct  <  1:1583960/61‑1 (MQ=255) aTCAGGATAACCGCTTGATCAAGCTGTGTTTCCCCCGCCAGGTTCCGACACCATGCctgct  <  1:1597631/61‑1 (MQ=255) aTCAGGATAACCGCTTGATCAAGCTGTGTTTCCCCCGCCAGGTTCCGACACCATGCctgct  <  1:722500/61‑1 (MQ=255)                                                             | ATCAGGATAACCGCTTGATCAAGCTGTGTTTCCCCCGCCAGGTTCCGACACCATGCCTGCT  >  W3110S.gb/3844713‑3844773

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑