Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3872531	3872711	181	77 [0]	[0] 27	yibJ	predicted Rhs‑family protein

TAACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTATT  >  W3110S.gb/3872480‑3872530                                                   | taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:328385/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:503343/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:476776/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:47308/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:45413/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:434222/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:380330/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:371300/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:366017/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:352231/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:514132/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:32759/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:324605/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:316060/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:313966/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:284054/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:281801/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:246343/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:212325/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:809593/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:966601/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:950057/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:9497/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:937896/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:914797/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:910692/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:844339/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:841253/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:835864/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:209610/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:795612/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:746793/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:71274/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:665895/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:657930/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:581706/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:57835/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:52144/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1203113/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1418223/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1414719/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1391951/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1384628/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1344844/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1299684/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1268690/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1242819/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1220037/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:197522/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:115610/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1147987/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1140947/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1130950/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:110139/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1091748/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1073213/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1048314/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1025639/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1540681/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1011303/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:19165/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:187189/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:166592/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1648854/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1646045/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1579790/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1556779/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1497305/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1479792/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1470557/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1470134/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1454774/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1454459/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1453123/51‑1 (MQ=255) taACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1430136/51‑1 (MQ=255)               aTTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:1591616/37‑1 (MQ=255)                ttAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTAtt  <  1:50336/36‑1 (MQ=255)                                                   | TAACTCTTTAGCTAATTAGCTAGCAAATGAATTTTGTCCTTTACCTGTATT  >  W3110S.gb/3872480‑3872530

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑