Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	48292	48506	215	31 [0]	[0] 34	kefC	potassium:proton antiporter

CCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCT  >  W3110S.gb/48230‑48291                                                              | ccAGTATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:15308/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:45906/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:975313/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:973333/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:892460/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:885551/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:621851/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:451936/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:296766/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:100620/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:1284060/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:258055/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:1378946/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:1531771/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:1037961/62‑1 (MQ=255) ccAGGATATCGCGGCGAGCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:442301/62‑1 (MQ=255)  cAGTATATCGCGGCTATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:691709/61‑1 (MQ=38)  cAGGATATCGCGGCTATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:531936/61‑1 (MQ=255)  cAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:1001429/61‑1 (MQ=255)  cAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:544772/61‑1 (MQ=255)  cAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:972859/61‑1 (MQ=255)  cAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:153210/61‑1 (MQ=255)  cAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:711389/61‑1 (MQ=255)  cAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:75384/61‑1 (MQ=255)  cAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:785037/61‑1 (MQ=255)  cAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:879186/61‑1 (MQ=255)         tCGCGGCGATCCCGCTGGGGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGGGCCt  <  1:631462/54‑1 (MQ=39)              gcgATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:294286/49‑1 (MQ=255)                      gCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:395202/41‑1 (MQ=255)                         ggtggCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:557306/38‑1 (MQ=255)                            ggCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt  <  1:1260197/35‑1 (MQ=255)                                                              | CCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCT  >  W3110S.gb/48230‑48291

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑