Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3914854	3914861	8	95 [0]	[0] 106	ysaB	hypothetical protein

GTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCAAA  >  W3110S.gb/3914792‑3914853                                                              | gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:445332/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:589468/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:576603/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:573691/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:568451/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:49779/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:483972/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:481516/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:450504/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:450071/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:447500/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:446977/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:590602/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:434320/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:41356/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:40723/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:393010/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:3924/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:353242/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:330599/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:328619/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:323503/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1035466/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:799262/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:979283/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:951697/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:949271/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:928491/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:894170/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:866471/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:865307/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:863477/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:855256/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:854977/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:825167/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:320526/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:79358/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:778755/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:763706/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:757814/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:734996/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:723841/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:706387/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:613582/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:606073/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:599172/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1258780/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1435543/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1418295/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1389863/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1388638/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1384626/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1378322/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:137384/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1357091/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1285287/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1278966/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1264185/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:304486/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1249/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1237547/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1220669/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1219068/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1213121/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1208142/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1177545/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1148924/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1122019/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1116831/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1074473/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1613378/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:314158/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:290377/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:284557/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:277496/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:264354/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:253054/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:230942/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:190802/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:170336/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1623516/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1620513/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1604505/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:155226/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1539635/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1537335/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:152153/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1497192/62‑1 (MQ=255) gTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1454872/62‑1 (MQ=255)  tAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:1365932/61‑1 (MQ=255)  tAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:153508/61‑1 (MQ=255)  tAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:144008/61‑1 (MQ=255)         tGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:581720/54‑1 (MQ=255)               tctGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:380028/48‑1 (MQ=255)                       cgttGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCaaa  <  1:467724/40‑1 (MQ=255)                                                              | GTAAAGGTTGATCCTCTGCGTTCGTTGAATATGGAAGCGTTATGCAAGGATCAGGCGGCAAA  >  W3110S.gb/3914792‑3914853

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑