Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3956406	3956614	209	35 [0]	[0] 117	yhjK	predicted diguanylate cyclase

ATATGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAC  >  W3110S.gb/3956345‑3956405                                                             | atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:739538/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:352048/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:354257/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:414389/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:465796/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:536476/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:57876/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:654690/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:681241/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:274106/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:754971/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:82922/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:84471/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:881279/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:883122/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:919502/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:928784/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:996586/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:1491746/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:1070158/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:11336/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:1225384/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:12994/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:1373741/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:1454712/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:1460017/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:147140/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:105553/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:1533525/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:1567810/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:1584394/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:159345/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:1617216/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:1637711/1‑61 (MQ=255) atatGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAc  >  1:225082/1‑61 (MQ=255)                                                             | ATATGCTGGAACTGTTAACCCGCTATCGCATTCAGCCGGGAACACTGATTCTGGAAGTGAC  >  W3110S.gb/3956345‑3956405

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑