Missing coverage evidence...
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CCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCG  >  W3110S.gb/3961689‑3961750                                                              | ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:642502/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:367116/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:395399/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:41975/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:453076/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:480854/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:489206/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:514909/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:565333/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:61240/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:632297/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:36632/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:675398/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:679742/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:69137/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:750829/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:810794/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:834811/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:839225/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:849989/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:953789/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:998988/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:130728/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1057709/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1062985/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1084345/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1098386/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1128867/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1130021/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1150240/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1168762/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1195778/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1297248/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1039368/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1378982/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1394710/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1400677/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1448886/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1499045/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1527986/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1542290/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1575484/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:1607148/62‑1 (MQ=255) ccGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:205324/62‑1 (MQ=255)                        tACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCg  <  1:835897/39‑1 (MQ=255)                                                              | CCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAAGTGAAGTGCG  >  W3110S.gb/3961689‑3961750

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑