Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3963786	3964061	276	39 [0]	[0] 41	yhjG	predicted outer membrane biogenesis protein

CGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATATT  >  W3110S.gb/3963725‑3963785                                                             | cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:622654/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:323036/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:359276/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:378548/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:423948/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:449607/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:497334/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:533083/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:566276/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:58414/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:283584/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:6315/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:677121/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:680689/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:752300/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:766866/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:772725/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:800916/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:806259/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:99260/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1224329/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1053715/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1071636/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1093126/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1162211/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:116459/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1166078/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1174976/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1199170/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1199303/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1033614/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1229423/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1305042/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1367201/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:1402631/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:211244/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:217883/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:219087/1‑61 (MQ=255) cGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATAtt  >  1:239483/1‑61 (MQ=255)                                                             | CGGTGCGATATTTGGTGATGATGAGGTGCGGGTGAACTGCGCGGCGGCGAATCTGAATATT  >  W3110S.gb/3963725‑3963785

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑