Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3971158 3971273 116 103 [0] [0] 11 [yhjA] [yhjA]

Only 100 of 103 total aligned reads displayed.

CATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGTC  >  W3110S.gb/3971097‑3971157
                                                            |
cATGTAATTGGTTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1210133/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:584079/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:610244/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:56839/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:565908/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:529852/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:486905/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:460584/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:451535/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:426327/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:416568/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:411992/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:380081/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:373591/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:373179/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:356054/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:332989/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:332733/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:318408/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:314088/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:311316/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:273684/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:273143/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:260106/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:251904/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1001666/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:791568/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:963222/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:940481/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:936835/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:935667/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:88351/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:866286/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:832955/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:820147/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:8160/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:811186/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:802636/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:24074/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:779008/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:771719/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:76461/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:73442/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:721910/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:708238/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:700405/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:699167/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:692265/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:652432/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:621256/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1184016/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:233104/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1414583/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1381053/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1379587/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1353421/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:135045/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1343248/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1324599/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1299502/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1294484/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1272563/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1223917/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1420285/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1180069/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1170149/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1167235/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1144158/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:112624/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1116590/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1116125/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:111294/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1063404/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1037538/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1026909/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1602116/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:210818/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:209534/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:205881/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:182550/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:177602/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1646515/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1627951/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1627331/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1620984/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1612870/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1425397/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1600497/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1564311/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1548024/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1517370/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1513055/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1492268/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:146876/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1451503/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1434971/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1425708/61‑1 (MQ=255)
cATGTAATTGATTGATTCCCATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:855188/61‑1 (MQ=255)
  tGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:464952/59‑1 (MQ=255)
     aaTTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGtc  <  1:1651387/56‑1 (MQ=255)
                                                            |
CATGTAATTGATTGATTCCTATCAAAAAGCGTATCTCCCTGTTTTTTATGATGGCTTTGTC  >  W3110S.gb/3971097‑3971157

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: