Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3987086 3987103 18 42 [1] [0] 28 slp/insH outer membrane lipoprotein/IS5 transposase and trans‑activator

TTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATGT  >  W3110S.gb/3987030‑3987090
                                                       |     
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:716620/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1014618/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:437825/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:452181/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:489667/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:499263/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:503843/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:53271/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:590322/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:633567/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:63499/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:375441/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:752794/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:777497/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:808041/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:835248/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:838/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:894460/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:95765/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:974364/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:988678/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1551580/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1022933/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1054961/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1120043/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1126353/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1236027/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1379147/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1475232/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:153282/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:369595/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1558276/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1584074/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1595307/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1615930/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:250196/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:276859/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:351741/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:362543/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:364708/1‑56 (MQ=255)
ttattGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTaataatag  >  1:959901/1‑59 (MQ=255)
ttattGTCAAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTtaat       >  1:1115599/1‑56 (MQ=255)
                                                       |     
TTATTGTCGAAGCAATTTCCGCTTTTGCTCGTAAAAGGTTGTCATTAATGGTTAATAATGT  >  W3110S.gb/3987030‑3987090

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: