Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3997623	3997791	169	41 [0]	[0] 43	yhiQ	predicted SAM‑dependent methyltransferase

GTGGATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGT  >  W3110S.gb/3997561‑3997622                                                              | gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:673022/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1022251/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:389231/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:414456/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:496323/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:549890/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:556269/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:564907/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:602201/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:633039/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:340289/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:689287/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:772563/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:786209/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:786474/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:840141/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:900959/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:925048/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:960055/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:980713/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1466164/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1056342/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:105727/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1080560/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1161119/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1260183/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1337315/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1369407/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1447510/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:26398/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1483132/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1598537/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1622205/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1632481/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1640723/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:204538/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:250977/62‑1 (MQ=255) gtggATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGCCGGCTGCCGCGt  <  1:716636/62‑1 (MQ=255) gtggAT‑CCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:975882/61‑1 (MQ=255)  tggATGCCACTGCAGGACTTGAGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1635786/61‑1 (MQ=255)           cTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGt  <  1:1607863/52‑1 (MQ=255)                                                              | GTGGATGCCACTGCAGGACTTGGGCGCGATGCCTTTGTACTGGCTTCAGTCGGCTGCCGCGT  >  W3110S.gb/3997561‑3997622

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑