Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4005060	4005209	150	75 [0]	[0] 48	yhiM	conserved inner membrane protein

CAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGACC  >  W3110S.gb/4004998‑4005059                                                              | cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:24269/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:500808/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:441011/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:417842/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:406455/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:317283/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:250535/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:243900/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:242989/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:512368/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:24167/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:214243/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:19676/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1631057/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1596003/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1587340/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:152955/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1525167/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:656672/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:959595/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:882596/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:857190/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:815434/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:790034/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:741791/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:740986/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:703079/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1010272/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:656513/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:638770/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:623895/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:612165/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:522925/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:521758/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:512743/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1137262/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1239395/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1234753/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1523264/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1224079/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:121082/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1201117/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1179206/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1139115/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:122975/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1134582/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1131380/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:112801/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1100905/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1095067/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1071148/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1057206/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1008011/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1253999/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1517737/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1490339/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1477760/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1467011/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1461387/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1455469/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1440099/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1429751/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1330432/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1288192/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1263591/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1255161/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1246877/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACAACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:914800/62‑1 (MQ=255) cAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGAACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:703480/62‑1 (MQ=255) cAATACGTCACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:799806/62‑1 (MQ=255) cAATAAGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1283283/62‑1 (MQ=255)  aaTACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1143221/61‑1 (MQ=255)  aaTACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1621261/61‑1 (MQ=255)       gTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:896156/56‑1 (MQ=255)                        gCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGAcc  <  1:1531520/39‑1 (MQ=255)                                                              | CAATACGTGACCCGCGACATAATGCGGAGTTATGTCAGCACTACGTAACAGCGTAATAGACC  >  W3110S.gb/4004998‑4005059

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑