Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4006848	4006959	112	91 [0]	[0] 18	yhiL	hypothetical protein

CATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTA  >  W3110S.gb/4006811‑4006847                                     | cATGTTTTTTTAAAGTACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:361918/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:536675/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:72825/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:721271/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:688391/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:669004/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:64278/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:610614/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:608369/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:592200/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:586635/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:586011/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:542377/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:736948/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:516533/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:483679/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:428602/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:420198/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:410707/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:370135/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:359511/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:355578/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:330096/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:866852/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:973646/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:973058/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:963251/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:955333/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:946231/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:933986/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:932026/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:919589/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:917162/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:903393/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:288793/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:846295/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:839433/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:808225/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:80623/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:80365/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:794539/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:774339/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:752160/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:750685/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:74442/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1250230/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1018141/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1374335/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1338613/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1335867/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1333281/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:13083/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1297434/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:126756/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1263345/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1256348/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1386262/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1201204/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:11925/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1192304/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1166129/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1163982/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1117191/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1107193/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1073800/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1066270/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1050839/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1648055/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:275991/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:274194/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:273175/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:265348/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:256396/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:239224/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:217183/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:178888/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:175873/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:173793/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1389338/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1607041/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1605357/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:154289/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:153976/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1499544/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1488616/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1475928/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:145113/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1397769/1‑37 (MQ=255) cATGTTTTTTTAAAGGACGATACGATAACCCCTTGTa  >  1:1076486/1‑37 (MQ=255) cATGTTTATTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:1259016/1‑37 (MQ=255)  aTGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTa  >  1:553086/1‑36 (MQ=255)                                     | CATGTTTTTTTAAAGGACGATGCGATAACCCCTTGTA  >  W3110S.gb/4006811‑4006847

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑