Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4016870	4016909	40	43 [0]	[0] 19	yhhH	hypothetical protein

TCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACG  >  W3110S.gb/4016808‑4016869                                                              | tCTTATCATATATCTCAGCTAATTCCTATGCTATAGCTTTATTTTTATCCAAATTTCTAACg  <  1:1453736/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTTATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:344339/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:632460/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:300225/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:314323/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:33168/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:42066/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:456134/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:554373/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:557435/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:561805/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:288998/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:635875/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:684189/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:708758/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:787852/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:796641/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:861181/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:908135/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:992805/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:994548/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:287919/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:1089838/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:117971/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:1227202/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:1235131/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:124061/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:1255137/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:1353919/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:1533874/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:157746/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:163161/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:182997/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:225889/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:1005780/62‑1 (MQ=255) tCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTAATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:266357/62‑1 (MQ=255)  cTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:578082/61‑1 (MQ=255)  cTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:25075/61‑1 (MQ=255)  cTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:1169950/61‑1 (MQ=255)  cTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:872432/61‑1 (MQ=255)  cTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:109017/61‑1 (MQ=255)    tAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTCACg  <  1:1089588/59‑1 (MQ=255)        atatatCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACg  <  1:1473827/55‑1 (MQ=255)                                                              | TCTTAACATATATCTCAGCTAATTCCAATGCTATAGCTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACG  >  W3110S.gb/4016808‑4016869

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑