Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4017691	4021502	3812	8 [0]	[0] 101	[rhsB]–[nikR]	[rhsB],[nikR]

CTCCTCATCATACTGCTGCCCCGGCAGCCGGATAAGCTGCTGCAGCTGATGCGGGTTCTCTT  >  W3110S.gb/4017629‑4017690                                                              | ctcctcATCATACTGCTGCCCCGGCAGCCGTATAAGCTGCTGCAGCTGATGCGGGTTCTCtt  <  1:874921/62‑1 (MQ=25) ctcctcATCATACTGCTGCCCCGGCAGCCGTATAAGCTGCTGCAGCTGATGCGGGTTCTCtt  <  1:977580/62‑1 (MQ=25) ctcctcATCATACTGCTGCCCCGGCAGCCGGATAAGCTGCTGCAGCTGATGCGGGTTCTCtt  <  1:335067/62‑1 (MQ=35) ctcctcATCATACTGCTGCCCCGGCAGCCGGATAAGCTGCTGCAGCTGATGCGGGTTCTCtt  <  1:711275/62‑1 (MQ=35) ctcctcATCATACTGCTGCCCCGGCAGCCGGATAAGCTGCTGCAGCTGATGCGGGTTCTCtt  <  1:795474/62‑1 (MQ=35) ctcctcATCATACTGCTGCCCCGGCAGCCGGATAAGCTGCTGCAGCTGATGCGGGTTCTCtt  <  1:848683/62‑1 (MQ=35)          atACTGCTGCCCCGGCAGCCGGATAAGCTGCTGCAGCTGATGCGGGTTCTCtt  <  1:379456/53‑1 (MQ=35)                   ccccGGCAGCCGGATAAGCTGCTGCAGCTGATGCGGGTTCTCtt  <  1:926854/44‑1 (MQ=38)                                                              | CTCCTCATCATACTGCTGCCCCGGCAGCCGGATAAGCTGCTGCAGCTGATGCGGGTTCTCTT  >  W3110S.gb/4017629‑4017690

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑