Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4104300 4104359 60 94 [0] [0] 230 ompR DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with EnvZ

GGCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAG  >  W3110S.gb/4104238‑4104299
                                                             |
ggCTGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:869392/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAGCTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:901397/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTTCGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1239322/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:345910/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:555129/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:54669/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:541573/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:536644/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:514180/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:507713/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:473870/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:46980/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:457721/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:441106/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:631436/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:31661/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:279424/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:270362/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:235255/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1033704/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:219430/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:198452/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:191474/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:775137/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:985137/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:98359/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:972986/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:963970/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:937907/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:894874/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:853836/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:843052/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:78210/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:579866/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:763969/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:763081/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:699439/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:686735/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:677761/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:64092/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:634628/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:222413/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:609385/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1194680/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1497139/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1175808/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1477868/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1433955/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1428281/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1427606/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:174570/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:14213/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1395495/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1151336/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1200906/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1327008/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1313460/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1308948/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:120686/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1234551/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1260552/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1236069/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1530263/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:170108/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:165978/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1092574/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1614965/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1609467/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1579093/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1549946/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1136097/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1524330/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1519829/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1517019/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1515058/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1512094/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1506987/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1143589/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCACGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:21461/62‑1 (MQ=255)
ggCGGTAATTGCTTTCAGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1426503/62‑1 (MQ=255)
 gCGGTATTTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:80909/61‑1 (MQ=255)
 gCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1209192/61‑1 (MQ=255)
 gCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:713034/61‑1 (MQ=255)
 gCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:540155/61‑1 (MQ=255)
 gCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:536293/61‑1 (MQ=255)
 gCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:524942/61‑1 (MQ=255)
 gCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:409459/61‑1 (MQ=255)
 gCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1088660/61‑1 (MQ=255)
  cGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:801141/60‑1 (MQ=255)
  cGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:673348/60‑1 (MQ=255)
  cGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:1151116/60‑1 (MQ=255)
  cGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:164196/60‑1 (MQ=255)
   ggTATTTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAg  <  1:757347/59‑1 (MQ=255)
                         aaaCTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCTAAg  <  1:1353053/37‑1 (MQ=255)
                                                             |
GGCGGTAATTGCTTTCGGTAAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAG  >  W3110S.gb/4104238‑4104299

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: