Missing coverage evidence...
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TTGTTGCTTTCGGCATTCAGCGCCAGAGAGATCGGTGCCGCGCTGGCTCCCGTTGGGCCAGG  >  W3110S.gb/4113690‑4113751                                                              | ttgttgCTTTCGGCATTCAGCGCCAGAGAGATCGGTGCCGCGCTGGCTCCCGTTGGGCCAgg  <  1:676003/62‑1 (MQ=255) ttgttgCTTTCGGCATTCAGCGCCAGAGAGATCGGTGCCGCGCTGGCTCCCGTTGGGCCAgg  <  1:243906/62‑1 (MQ=255) ttgttgCTTTCGGCATTCAGCGCCAGAGAGATCGGTGCCGCGCTGGCTCCCGTTGGGCCAgg  <  1:252739/62‑1 (MQ=255) ttgttgCTTTCGGCATTCAGCGCCAGAGAGATCGGTGCCGCGCTGGCTCCCGTTGGGCCAgg  <  1:266607/62‑1 (MQ=255) ttgttgCTTTCGGCATTCAGCGCCAGAGAGATCGGTGCCGCGCTGGCTCCCGTTGGGCCAgg  <  1:316195/62‑1 (MQ=255) ttgttgCTTTCGGCATTCAGCGCCAGAGAGATCGGTGCCGCGCTGGCTCCCGTTGGGCCAgg  <  1:320061/62‑1 (MQ=255) ttgttgCTTTCGGCATTCAGCGCCAGAGAGATCGGTGCCGCGCTGGCTCCCGTTGGGCCAgg  <  1:326553/62‑1 (MQ=255) ttgttgCTTTCGGCATTCAGCGCCAGAGAGATCGGTGCCGCGCTGGCTCCCGTTGGGCCAgg  <  1:33678/62‑1 (MQ=255) ttgttgCTTTCGGCATTCAGCGCCAGAGAGATCGGTGCCGCGCTGGCTCCCGTTGGGCCAgg  <  1:403537/62‑1 (MQ=255) 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TTGTTGCTTTCGGCATTCAGCGCCAGAGAGATCGGTGCCGCGCTGGCTCCCGTTGGGCCAGG  >  W3110S.gb/4113690‑4113751

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑