Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4121489	4122086	598	66 [0]	[0] 57	[aroK]–[aroB]	[aroK],[aroB]

TCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCT  >  W3110S.gb/4121428‑4121488                                                             | tCAACAACTCATTATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGCTTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1618377/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTGCGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:265075/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:509515/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:587288/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:573542/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:523655/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:521577/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:520262/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:519697/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:514016/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:652733/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:489968/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:466825/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:439890/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:409939/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:387912/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1006344/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:386616/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:666598/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:672339/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:682732/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:69156/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:730829/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:749111/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:780559/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:796943/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:880386/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:894505/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:92039/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:924183/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:955406/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:969980/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:981113/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:323453/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1119353/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1192792/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1221963/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1272466/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1288778/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1293880/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1317827/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:135817/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1393211/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1428007/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1449552/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1457204/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1476173/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1486513/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1533474/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:386497/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:290722/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:261439/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:227132/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:219159/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:195328/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1645443/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1574350/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1562842/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1550046/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1540387/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1517619/61‑1 (MQ=255) tCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTACGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:935102/61‑1 (MQ=255)  caacaaCTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:232730/60‑1 (MQ=255)  caacaaCTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:937087/60‑1 (MQ=255)  caacaaCTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:1015768/60‑1 (MQ=255)            atatGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCt  <  1:927062/50‑1 (MQ=255)                                                             | TCAACAACTCAATATGGAATTTTACGATTCCGATCAAGAGATTGAGAAACGAACCGGAGCT  >  W3110S.gb/4121428‑4121488

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑