Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4159362	4159436	75	36 [0]	[0] 63	kefG	component of potassium effux complex with KefB

CGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAT  >  W3110S.gb/4159300‑4159361                                                              | cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:572139/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1040903/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:289838/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:358048/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:438239/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:448113/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:496397/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:566364/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:570065/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1633246/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:575624/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:60790/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:764645/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:782112/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:809256/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:862712/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:890896/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:952255/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1264039/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1046873/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1082031/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1197990/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1216010/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1233833/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1241174/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1265623/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1278797/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1282121/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1434265/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1596343/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1604080/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1604100/62‑1 (MQ=255) cGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGATCAGCAAt  <  1:132223/62‑1 (MQ=255)     aTCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:163166/58‑1 (MQ=255)           ggACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAt  <  1:1071599/52‑1 (MQ=255)            gACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCGCAGCAAt  <  1:766990/51‑1 (MQ=255)                                                              | CGGAATCTCAGGACTCGGTGGCAAACCGGGTACTGCTTAAACCGGCCACGCAGCTCAGCAAT  >  W3110S.gb/4159300‑4159361

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑