Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4200091 4200189 99 103 [0] [0] 45 rpoA RNA polymerase, alpha subunit

Only 100 of 103 total aligned reads displayed.

GCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTA  >  W3110S.gb/4200049‑4200090
                                         |
tcAACCATTCTGGCTGATCAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:265659/41‑1 (MQ=38)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:649656/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:700868/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:638880/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:636208/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:634230/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:621929/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:618799/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:559803/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:530550/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:52150/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:508042/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:504618/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:475566/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:46543/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:462237/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:451908/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:451295/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:380494/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:359154/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:342886/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:342460/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:338772/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:327577/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1009270/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:861236/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:96566/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:949250/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:942001/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:932410/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:925066/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:91742/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:904057/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:894584/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:87624/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:872076/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:866880/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:310258/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:840215/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:827952/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:825168/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:817959/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:817066/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:8038/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:757231/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:742811/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:736481/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:734222/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:706812/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1213463/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1404793/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:242450/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1366934/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1338427/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1333578/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1321305/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1279244/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1266660/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1260642/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:124207/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1235017/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1376922/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1193948/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1192638/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1166110/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1162722/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1122660/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1116550/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1102103/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:108848/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1085479/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1046549/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1012885/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1434523/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:236868/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:219582/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:191636/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1645781/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1635004/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1617616/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1589797/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1586716/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1581430/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1568372/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1547995/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1547540/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1545581/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1514823/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1499678/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1498015/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1464180/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1451671/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1449047/42‑1 (MQ=255)
gCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1432495/42‑1 (MQ=255)
 cAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:851905/41‑1 (MQ=255)
 cAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1143959/41‑1 (MQ=255)
 cAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1616218/41‑1 (MQ=255)
     cATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:1216207/37‑1 (MQ=255)
     cATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:404030/37‑1 (MQ=255)
      aTTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTa  <  1:897024/36‑1 (MQ=255)
                                         |
GCAACCATTCTGGCTGAACAACTGGAAGCTTTCGTTGACTTA  >  W3110S.gb/4200049‑4200090

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑