Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4249057	4249146	90	34 [0]	[0] 121	malE	maltose transporter subunit

TCGCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTAA  >  W3110S.gb/4248997‑4249056                                                            | tCGCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:1127704/60‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:764128/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:342250/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:365387/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:394414/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:447371/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:50886/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:651120/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:689867/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:732443/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:300138/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:823273/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:870101/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:886040/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:886128/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:922586/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:961714/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:1487596/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:110320/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:129628/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:1335073/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:1356175/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:1360852/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:145945/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:1486985/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:1036286/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:1545462/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:1555717/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:155952/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:1635847/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:259129/58‑1 (MQ=255)   gCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:283535/58‑1 (MQ=255)    ccAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:517665/57‑1 (MQ=255)                       cTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTaa  <  1:1404323/38‑1 (MQ=255)                                                            | TCGCCAACTCTTCCTCGTAAGACTTCAGCGCTACGGCACCCAGCGGTTTGTCTTTATTAA  >  W3110S.gb/4248997‑4249056

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑