Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4313534	4313993	460	78 [0]	[0] 18	alsC	D‑allose transporter subunit

CACCAGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCA  >  W3110S.gb/4313472‑4313533                                                              | cagcaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:127151/59‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTGACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:104255/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATTCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:402566/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGTAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:527052/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGGATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:195143/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:410118/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:642289/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:629150/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:626123/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:618122/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:607686/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:587584/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:554347/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:516167/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:465335/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:675941/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:373772/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:348750/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:275357/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:243277/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:234647/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:792744/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:976769/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:960965/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:945015/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:906018/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:88355/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:856029/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:845491/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:813944/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:79397/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:667060/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:784021/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:760388/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:739971/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:725457/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:72245/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:722384/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:684682/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:229027/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:12808/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1417931/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1411899/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1396183/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1376222/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1372626/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1311984/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1290101/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1285288/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1419258/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1148910/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1129176/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1126846/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:111439/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1101443/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1051309/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1031608/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1469661/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:182335/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1643771/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1631463/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1611083/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1589612/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1566042/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1552716/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1545273/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:15418/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1539275/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1511648/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1501804/62‑1 (MQ=255) caccaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1485451/62‑1 (MQ=255)  acctGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1591427/61‑1 (MQ=255)  accaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:731281/61‑1 (MQ=255)  accaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:362557/61‑1 (MQ=255)  accaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1021535/61‑1 (MQ=255)  accaGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:185103/61‑1 (MQ=255)        aTGTGGAATTTCACGTCATTCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:129734/55‑1 (MQ=255)                     cGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCa  <  1:1454834/42‑1 (MQ=255)                                                              | CACCAGGATGTGGAATTTCACGTCAATCCCGGAATAGAACGCCGAATTTTTGTTGCCGCCCA  >  W3110S.gb/4313472‑4313533

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑