Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4468307	4468450	144	65 [0]	[0] 70	treC	trehalose‑6‑P hydrolase

CGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGCCC  >  W3110S.gb/4468248‑4468306                                                           | cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCTGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1397018/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCcccc  <  1:504674/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:533468/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:695951/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:694227/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:672962/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:626285/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:620323/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:574916/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:571284/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:736192/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:48861/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:413315/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:379682/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:378883/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:333722/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1040193/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:33328/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:738591/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:748525/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:767441/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:768624/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:778995/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:801330/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:810515/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:825431/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:827308/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:843167/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:887370/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:892756/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:972008/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:999522/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1432071/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1098991/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1141159/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1160697/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1204380/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1212078/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1287425/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1295796/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1304694/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:133844/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1341027/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1388934/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:138975/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1395265/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1405238/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:292381/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1477165/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1483354/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:149962/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1534752/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1558289/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:260982/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1621554/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:240232/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:188328/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGGCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1233121/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGACATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:492146/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGGTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1569117/59‑1 (MQ=255) cGTCGCGATAGTCAGTAAAGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:692716/59‑1 (MQ=255)  gTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:719986/58‑1 (MQ=255)      cgATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1639906/54‑1 (MQ=255)                 aaTGCGCGTGAAATGCGGGTTTGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:1597210/43‑1 (MQ=255)                  aTGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGccc  <  1:198435/42‑1 (MQ=255)                                                           | CGTCGCGATAGTCAGTAATGCGCGTGAAATGCGGGTTGGTCATGCCAATCTCTTCGCCC  >  W3110S.gb/4468248‑4468306

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑