Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4499816	4500507	692	56 [0]	[0] 104	[idnK]–[yjgB]	[idnK],[yjgB]

ATCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAC  >  W3110S.gb/4499755‑4499815                                                             | atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGAtactac  <  1:452960/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:595988/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1072174/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:404282/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:439032/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:462658/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:490248/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:495097/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:504509/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:532529/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:556827/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:559455/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:56699/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:578920/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:379398/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:655981/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:663441/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:752710/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:772351/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:851540/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:921321/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:929824/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:95656/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:960470/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:972801/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:984610/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:99355/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:36022/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1089628/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1092216/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1096702/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1146714/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1154550/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1208428/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1209180/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1210613/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1254570/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1272821/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1307480/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1385762/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1394863/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1459400/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1489449/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1502782/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1519176/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1527946/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1637228/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1650187/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:216956/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:262376/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:263961/61‑1 (MQ=255) atCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:378432/61‑1 (MQ=255)  tCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1647027/60‑1 (MQ=255)     aCCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:58869/57‑1 (MQ=255)           atatTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:618033/51‑1 (MQ=255)                      gTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAc  <  1:1328111/40‑1 (MQ=255)                                                             | ATCAACCATGATATTGCCAATGTCACCGAACAATGTCGGCAGGCTGTGCTGGCGATACGAC  >  W3110S.gb/4499755‑4499815

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑