Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4507463	4507661	199	55 [0]	[0] 109	insG	IS4 predicted transposase

CTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTAA  >  W3110S.gb/4507402‑4507462                                                             | cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGTCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1588522/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:639234/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1029461/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:342949/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:344501/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:391209/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:400240/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:437131/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:501854/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:515394/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:541528/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:546478/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:606965/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:628523/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:341925/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:694909/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:740116/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:741861/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:821559/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:829260/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:841199/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:851193/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:880069/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:960751/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:984672/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:989348/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:999898/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1242896/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1038555/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1088695/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:111365/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1133159/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1141852/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1156647/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1204030/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1222931/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1231192/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1238366/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:326420/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:126057/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1279951/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1287185/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:139404/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1462823/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1474366/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1486118/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1593445/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:1651011/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:211591/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:271521/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:315348/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGAGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:114817/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTAGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:62199/61‑1 (MQ=255) cTCCCTTTCTGAGAGATATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:973843/61‑1 (MQ=255) cTCCCATTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTaa  <  1:771842/61‑1 (MQ=255)                                                             | CTCCCTTTCTGAGAGGTATCATCCAGTGGCGGTGTTCTCCCGCCAGGCTCCAGGCATTTAA  >  W3110S.gb/4507402‑4507462

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑