Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4543120 4543224 105 43 [0] [0] 44 yjhT conserved hypothetical protein

GCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGT  >  W3110S.gb/4543058‑4543119
                                                             |
gCCCGCCATGCCCATCGGCTCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:792328/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:754380/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:319285/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:333370/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:380088/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:473818/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:477126/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:533495/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:585007/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:588605/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:677182/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1055369/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:839253/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:919686/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:92133/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:92198/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:955534/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:95767/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:972608/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:977267/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1447406/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1171031/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1197153/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1205952/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1217912/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1255108/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1261704/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1310422/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1431933/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1154348/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1570335/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1594220/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1147918/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1070172/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1607305/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1001547/62‑1 (MQ=255)
gCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:206929/62‑1 (MQ=255)
 cccGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1648473/61‑1 (MQ=255)
 cccGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:418151/61‑1 (MQ=255)
  ccGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:38335/60‑1 (MQ=255)
                     gTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:1511108/41‑1 (MQ=255)
                          aCATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:161967/36‑1 (MQ=255)
                          aCATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGt  <  1:981360/36‑1 (MQ=255)
                                                             |
GCCCGCCATGCCCATCGGCGCGTGCGACATCAATTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGT  >  W3110S.gb/4543058‑4543119

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: