Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4548042 4549299 1258 100 [0] [0] 57 [fimA]–[fimC] [fimA],fimI,[fimC]

AGGAGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGAA  >  W3110S.gb/4548000‑4548041
                                         |
aggaGCATCCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:322022/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTTACATTCAGCTGaa  <  1:552753/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCATCTGaa  <  1:638305/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTTaa  <  1:374501/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:415338/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:191056/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:544073/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:510854/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:506455/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:505792/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:101218/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:487306/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:471763/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:469230/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:425455/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:204641/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:376159/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:562917/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:341489/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:340731/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:328790/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:199295/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:299484/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:293993/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:270931/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:782800/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:981049/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:972200/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:930014/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:925396/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:918239/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:901932/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:891540/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:881873/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:865199/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:841692/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:790795/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:193890/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:759278/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:746948/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:731893/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:726263/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:681580/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:676462/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:629189/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:604142/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:576730/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:569003/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1174562/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1428506/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1427201/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:178037/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1338909/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1329155/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1292976/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1286088/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1226025/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:120776/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1189782/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1179103/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1370147/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:116806/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:114759/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1132755/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1132261/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1084888/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1082373/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1056704/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1043806/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1035204/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1021229/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1018737/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:153557/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:174559/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1629899/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1617977/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1607951/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:15810/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1563589/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1557758/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1546302/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:153709/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1434888/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1519971/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1518128/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1517959/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:151517/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1486825/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:148541/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1476131/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1464944/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1445292/42‑1 (MQ=255)
aggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1438461/42‑1 (MQ=255)
 ggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:473531/41‑1 (MQ=255)
 ggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:893503/41‑1 (MQ=255)
 ggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1064647/41‑1 (MQ=255)
 ggaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:912262/41‑1 (MQ=255)
  gaGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1216150/40‑1 (MQ=255)
    gCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:1600538/38‑1 (MQ=255)
      aaCCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGaa  <  1:65515/36‑1 (MQ=255)
                                         |
AGGAGCAACCAGTTCTGCTGTCGGTTTTAACATTCAGCTGAA  >  W3110S.gb/4548000‑4548041

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: