Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4549533	4549745	213	70 [0]	[0] 36	[fimC]	[fimC]

CAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACAC  >  W3110S.gb/4549476‑4549532                                                         | cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGagac  >  1:629812/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:435618/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:531958/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:490627/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:470635/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:458351/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:448938/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:443659/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:443507/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:570285/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:40190/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:398447/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:396797/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:373301/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:370117/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:325467/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:303188/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1001158/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:756057/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:990470/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:983164/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:876016/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:845813/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:828211/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:818680/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:804122/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:796534/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:543947/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:730695/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:710951/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:658902/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:646421/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:58940/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:576134/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:258488/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1116865/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1249139/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1223761/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1207257/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1197476/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1175872/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1170632/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1128339/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1128162/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1262359/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1114103/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1109092/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1105159/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1054644/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1035944/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1023696/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:101003/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1002495/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1472218/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:202111/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:16732/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:166344/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:16049/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1559420/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1531543/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1490707/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:223836/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1429388/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1412829/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1378579/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1359031/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1348607/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1348253/1‑57 (MQ=255) cAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:1275198/1‑57 (MQ=255)  aGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGacac  >  1:419443/1‑56 (MQ=255)                                                         | CAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACAC  >  W3110S.gb/4549476‑4549532

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑