Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4580397	4581056	660	65 [0]	[0] 34	yjiV	ECK4334:JW5954:b4486; conserved hypothetical protein

GGATTTGCCCGGTAACCAAT‑AAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCT  >  W3110S.gb/4580336‑4580396                                                               | ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:548335/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:107823/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:21863/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:237795/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:292403/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:311134/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:317107/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:330362/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:397361/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:402407/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:402877/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:41532/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:497980/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:520816/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:538050/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:543877/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:173173/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:58992/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:612878/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:630324/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:637581/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:638149/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:641547/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:677566/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:720673/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:835702/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:841693/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:842881/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:871168/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:913259/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:940570/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:946155/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1337020/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:108591/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1137012/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1137689/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1140307/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1149240/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1156849/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1169786/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1184735/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1240866/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1255121/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1256757/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1282364/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1308657/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1651486/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1456348/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1650053/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:164505/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1640110/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1603683/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1603014/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1602391/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:159483/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1580549/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1547122/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1503249/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1465857/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1464096/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1376889/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACACCTTATCt  <  1:1333918/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAAT‑AAAAGTCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:786454/62‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCGGTAACCAAT‑AAAAGTCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:788386/62‑1 (MQ=255)  gATTTGCCCGGTAACCAATAAAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt  <  1:1614524/61‑1 (MQ=255)                                                               | GGATTTGCCCGGTAACCAAT‑AAAA‑TCCTGGATACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCT  >  W3110S.gb/4580336‑4580396

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑